Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcd1P48410 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcd1P48410 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms