Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edn3P48299 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edn3P48299 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edn3P48299 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edn3P48299 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms