Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbx2P48031 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx2P48031 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms