Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RpiaP47968 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpiaP47968 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms