Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gli1P47806 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gli1P47806 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gli1P47806 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gli1P47806 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms