Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf4P43488 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms