Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms