Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp9P41245 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp9P41245 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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