Protein–RNA interactions for Protein: P41216

Acsl1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl1P41216 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl1P41216 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsl1P41216 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms