Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl28P41105 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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