Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt4P40749 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt4P40749 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt4P40749 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syt4P40749 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt4P40749 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms