Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VhlP40338 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VhlP40338 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VhlP40338 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VhlP40338 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VhlP40338 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VhlP40338 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VhlP40338 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VhlP40338 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VhlP40338 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VhlP40338 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VhlP40338 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VhlP40338 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VhlP40338 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VhlP40338 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms