Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn1P35821 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms