Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms