Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc1P34928 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms