Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnar1P33896 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ifnar1P33896 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms