Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Oprk1P33534 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Oprk1P33534 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oprk1P33534 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oprk1P33534 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oprk1P33534 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oprk1P33534 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms