Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa11P31311 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms