Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msr1P30204 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msr1P30204 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msr1P30204 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msr1P30204 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msr1P30204 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msr1P30204 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msr1P30204 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msr1P30204 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msr1P30204 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msr1P30204 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msr1P30204 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms