Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VtnP29788 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VtnP29788 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VtnP29788 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VtnP29788 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VtnP29788 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VtnP29788 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VtnP29788 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VtnP29788 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VtnP29788 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VtnP29788 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VtnP29788 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VtnP29788 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VtnP29788 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VtnP29788 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VtnP29788 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VtnP29788 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VtnP29788 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VtnP29788 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VtnP29788 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VtnP29788 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VtnP29788 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VtnP29788 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VtnP29788 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VtnP29788 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VtnP29788 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VtnP29788 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VtnP29788 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VtnP29788 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VtnP29788 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VtnP29788 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VtnP29788 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VtnP29788 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VtnP29788 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VtnP29788 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VtnP29788 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms