Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc1P29341 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pabpc1P29341 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms