Protein–RNA interactions for Protein: P28649

Cyp19a1, Aromatase, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp19a1P28649 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp19a1P28649 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp19a1P28649 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp19a1P28649 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms