Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd10P28359 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms