Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb3P28231 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms