Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb1P28230 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms