Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms