Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-DMaP28078 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms