Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl6P27784 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl6P27784 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl6P27784 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl6P27784 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms