Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb7P26011 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms