Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnd1P25322 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms