Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf8P23611 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf8P23611 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf8P23611 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf8P23611 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf8P23611 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms