Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6bP23440 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6bP23440 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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