Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcb1aP21447 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms