Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5bP21271 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myo5bP21271 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms