Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klra1P20937 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klra1P20937 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klra1P20937 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Klra1P20937 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klra1P20937 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Klra1P20937 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms