Protein–RNA interactions for Protein: P20334

Tnfrsf9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf9P20334 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf9P20334 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf9P20334 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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