Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms