Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn1s1P19228 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms