Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18530 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18530 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18530 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18530 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18530 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18530 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18530 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18530 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18530 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18530 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18530 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18530 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18530 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18530 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18530 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18530 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18530 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18530 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18530 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18530 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18530 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18530 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P18530 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18530 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18530 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18530 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P18530 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18530 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18530 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18530 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18530 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18530 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18530 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18530 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms