Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb1P17919 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms