Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnni2P13412 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnni2P13412 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms