Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms