Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcsP12246 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcsP12246 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApcsP12246 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms