Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamp1P11438 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms