Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sub1P11031 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sub1P11031 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sub1P11031 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sub1P11031 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sub1P11031 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sub1P11031 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sub1P11031 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sub1P11031 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sub1P11031 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms