Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl2P10148 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms