Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Schip1P0DPB4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Schip1P0DPB4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms