Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms