Protein–RNA interactions for Protein: P0C673

Igsf11, Immunoglobulin superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf11P0C673 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf11P0C673 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Igsf11P0C673 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igsf11P0C673 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms