Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csf3P09920 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csf3P09920 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csf3P09920 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Csf3P09920 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms